代理记账许可证的办理流程及出证机构如下：
一、办理条件
根据《代理记账管理办法》（财政部令第98号），申请代理记账许可证需满足以下条件：
机构性质：依法设立的企业（非会计师事务所）。
人员要求：
专职从业人员不少于3名，均需持有会计从业资格证书，并具备独立处理基本会计业务的能力。
主管代理记账业务的负责人需具有会计师以上专业技术职务资格，或从事会计工作不少于3年且为专职人员。
场所与制度：
有固定的办公场所（需提供房产证或租赁协议）。
建立健全的代理记账业务规范和财务会计管理制度。
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二、办理流程
名称预先核准：
向工商部门申请企业名称预先核准，确保经营范围包含“代理记账”业务。
准备申请材料：
基础材料：
代理记账资格申请表（通过全国代理记账机构管理系统填报）。
营业执照副本及复印件。
办公场所证明（房产证或租赁协议）。
人员材料：
主管负责人及专职从业人员的身份证、会计从业资格证书原件及复印件。
主管负责人会计师以上职称证书或从事会计工作3年以上的书面承诺。
全体从业人员专职从业的书面承诺。
制度材料：
代理记账业务规范、财务会计管理制度、档案管理制度等。
网上申报：
登录全国代理记账机构管理系统（http://dljz.mof.gov.cn/），按系统提示填写信息并上传材料。
审核与领证：
财政部门在20个工作日内完成审核，审核通过后颁发《代理记账许可证》。
申请人可选择邮寄或现场领取证书。
三、出证机构
代理记账许可证由县级以上地方人民政府财政部门核发，具体为：
审批权限：根据机构所在地，由区、县级市财政局负责审批。
法律依据：
《代理记账管理办法》第三条明确规定，除会计师事务所以外的机构从事代理记账业务，需经财政部门批准并领取许可证。
未经批准擅自从事代理记账业务的，将由财政部门依法查处。
四、注意事项
年度备案：
代理记账机构需于每年4月30日前向审批机关报送基本情况表、从业人员变动情况等材料。
合规经营：
取得许可证后，需依法办理工商登记、税务登记等手续，确保合法经营。
变更与注销：
机构名称、负责人等发生变更时，需及时向审批机关办理变更登记。