2025年围绕“企业资格认定和监督管理”各相关单位开展了专项整治工作，比如“专精特新专项整治”、“落实高企审计整改”、“研发费加计扣除稽核”，面对多轮核查，企业普遍反映：“资料反复提交，但每次重点又不一样！”
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一、核查工作的基本要求
1.专精特新核实材料要求
核实企业研发场地、核实企业财务系统数据与申报数据研发费用，要求企业财务人员、技术人员在场协助；
核查备查资料包括，研发费用专账或辅助账、管理制度文件、财务系统及社保系统、财务审计报告、研发设备清单、申报书全套
2.高企风险核实要求
这不是申报核查，针对税务部门反馈存在税务风险点的企业进行检查核对，重点材料包括：
（1）产品销售合同、销售发票；收入明细表及相关财务核算凭证；
（2）科技人员劳动合同、学历/职称证明；近半年职工工资发放记录、个人所得税申报记录及社保缴费凭证；
（3）核验企业近三年企业财务报表及审计报告；研发场所、设备清单及使用记录；
（4）核验近三年企业所得税年度纳税申报表；近三年财务审计报告、研发费用专项审计报告；研发费用专账、辅助账及支出明细。
3.加计扣除稽核资料
根据《研发费用加计扣除优惠政策提级管理资料清单》，企业需要提供：
「研发项目的决策、流程管理等相关资料、研发人员情况、研发活动耗用材料、使用的仪器设备及无形资产等情况、委托（包括委托境内和境外）、合作研究开发情况、集中研发情况、其他相关费用情况、“研发支出”辅助账及汇总表、送审鉴定意见等资料。」
二、核心核查维度对比概览
三、结论与建议
简单归纳，三者核查有较大差异，比如省专精特新聚焦申报条件（尤其是研发投入和场地）的基础真实性和现场符合性，流程相对标准化；
高企（风险核查）针对高风险企业，目标明确指向税务反馈的风险点（如虚开、收入不实、人员造假、费用异常），核查深度、广度和针对性极强，旨在排除重大不合规；
研发加计扣除纯粹聚焦研发活动本身及费用归集的合规性、准确性、可追溯性，要求最细致的过程管理和凭证支撑。