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高企认定主管部门：科技、财政、税务部门，
其他相关部门：环保、质量/安监、审计等部门。
科技部门检查要点：
1.技术领域是否属于管理办法或工作指引中的领域
2.专利权属及专利时效确认
3.主要产品（服务）收入占高新收入比例是否超过50％
4.申报前后各期数据对比及与高新年报数据对比
5.申报材料各项指标核对
财政部门检查要点：
1.每年定期对承担高企审计的事务所进行底稿等风险检查，并抽选部分企业进行延伸检查
2.会计师事务所行业协会自律检查。
税务部门检查要点：
1.申报材料与税务申报数据是否有冲突
2.高企认定税收优惠备案检查
3.研发费用加计扣除备案检查
4.其他相关税务检查
环保部门检查要点：
1.是否存在环评风险
2.是否存在严重环境违法行为
质量/安监部门检查要点：是否存在重大质量、重大安全事故
审计部门检查要点：
1.针对行政公职人员渎职、受贿等违法行为的延伸检查
2.国有企业自身的定期审计检查
企业备查资料：
（1）知识产权证书
（2）科技成果转化证明材料
（3）研发活动证明材料
（4）研发费用明细账及相关凭证
（5）高新收入证明材料
（6）科技人员证明材料
（7）产学研合作证明材料
（8）检查部门要求的其他资料
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