高新技术企业不仅是荣誉资质，更与税收优惠直接挂钩。但税务机关对高新企业的检查力度逐年加大，不少企业因税务处理不规范，面临补税、罚款甚至取消高新资质的风险。本文总结了高新企业税务检查的核心注意事项。
一、研发费用加计扣除
风险点
1.研发费用范围 “越界”：将非研发活动支出计入加计扣除，如企业组织的技术培训费用、研发失败的罚款等；
2.资本化与费用化混淆：开发阶段支出未满足资本化条件却计入无形资产，或已符合资本化条件仍费用化处理；
3.辅助账不规范：未按项目设置研发支出辅助账，或辅助账与总账、明细账数据不一致。
二、高新技术企业税收优惠
风险点
1.资格失效后仍享受优惠：企业因未通过复核或被取消高新资质，却未及时停止享受 15% 税率优惠；
2.收入占比不达标：高新技术产品（服务）收入占比低于 60%，仍按 15% 税率申报；
3.备案材料不全：未留存研发项目立项文件、高新技术产品（服务）证明材料等备查。
三、关联交易：定价公允性需举证
风险点
1.关联方之间研发服务定价不合理：如母公司向子公司收取的研发服务费远高于市场价格，转移利润；
2.关联交易未申报：与关联方发生的研发材料采购、技术转让等交易，未在年度申报表中披露；
3.利用关联交易虚增研发费用：通过关联方开具虚假发票，虚增研发投入。
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四、科技人员薪酬：真实性与相关性要双达标
风险点
1.非研发人员薪酬计入研发费用：如将行政管理人员的工资纳入 “人员人工费用” 加计扣除；
2.薪酬发放凭证缺失：研发人员工资表无签字记录，或银行转账凭证与工资表金额不符；
3.兼职研发人员薪酬分摊不合理：未按实际参与研发时间分摊薪酬，全额计入研发费用。
五、增值税优惠：技术服务免税需合规
风险点
1.超范围享受免税：将非技术性服务（如设备维修、普通咨询）混入 “技术开发服务” 享受免税；
2.未办理免税备案：提供技术转让、技术开发服务前，未向税务机关办理增值税免税备案；
3.进项税额违规抵扣：用于免税项目的购进货物、服务，其进项税额未转出。
六、税务申报与资料留存
风险点
1.纳税申报数据与财务报表不一致：如研发费用加计扣除金额与利润表中 “研发费用” 项目金额差异过大；
2.备查资料缺失：无法提供研发项目的 “实验记录”“测试报告” 等证明研发活动真实性的材料；
3.申报后未复核：未核对 “企业所得税年度申报表” 与 “高新企业年度发展情况报表” 的数据一致性。
高新企业税务检查的核心是真实性与合规性，企业需将税务管理融入研发全流程，而非等到检查时临时补材料。守住税务合规底线，才能持续享受高新企业的政策红利。