ISO14001环境管理体系认证证书的办理流程主要包括以下几个阶段：
一、准备工作阶段
了解要求：企业需要详细了解ISO14001认证的相关要求和流程。
自我评估：评估自身环境管理体系与ISO14001标准之间的差距，明确需要改进的地方。
制定计划：根据评估结果，制定详细的整改计划，并着手实施。
二、申请认证阶段
准备材料：企业需要准备一系列申请材料，包括但不限于：
组织简介
认证申请书
法律地位的证明文件（如营业执照）的复印件
环境安全监测报告
“环评”、“安评”报告及批复、“三同时”验收报告
地理位置示意图及厂区平面示意图
主要工艺流程及污染物的产出示意图
申请组织一年内无重大事故证明
环境管理手册、程序文件（包括重要环境因素清单、法律法规清单以及目标、指标和环境管理方案）
环境管理体系概述（包括体系覆盖范围、体系运行时间、运行成效、内审及管理评审时间等）
提交申请：将准备好的申请材料提交给认证机构，并缴纳相关费用。
三、审核阶段
初审：认证机构对企业的环境管理体系进行初步审核，包括现场考察和文件审核。
整改：根据初审结果，认证机构会提出企业需要整改的环境管理体系问题清单。企业需要按照要求进行整改，并提交整改报告。
再审：整改完毕后，认证机构会进行再次审核，以确认企业的环境管理体系是否符合ISO14001标准的要求。
四、发证阶段
发放证书：如果企业的环境管理体系符合ISO14001标准的要求，认证机构会发放ISO14001认证证书。
监督审核：认证机构每年会对企业进行监督审核，以评估环境管理体系的有效性和持续改进情况。
五、注意事项
企业资格：企业需要具备国家工商行政管理部门或有关机构注册登记的法人资格，并按规定的时间段进行年检。
行政许可：如果适用，企业需要取得相关法规规定的行政许可文件，并能提供出有效期内的许可证或资质证书及年检证明。
合规性：企业的生产、加工的产品或提供的服务需要符合中华人民共和国相关法律、法规、安全卫生标准和有关规范的要求。
体系运行：企业的环境管理体系需要有效运行3个月以上，才能申请ISO14001认证。
六、费用
ISO14001认证具体费用根据企业的规模、面积、风险与复杂程度、体系成熟度、人数等因素进行核算。以及审核员到企业现场可能产生的差旅费。